按照惯例，罗马教皇安葬之前，应该在圣彼得大教堂举行十天的安魂弥撒。可是教皇的遗骸让人感到无限恐惧，没有任何人愿意参加弥撒。尸体的周围没有蜡烛和神香，也没有诵经人、守灵人和祈祷者。很久没有找到掘墓人。最后终于找到六个无赖汉，他们为了一杯葡萄酒无所不干。棺材不合适。于是从教皇的头上摘下三重冠，用一块破毯子代替盖尸布，踹了几脚才勉强把尸体塞进又短又窄的棺材里。还有人说，根本没有弄到棺材，在脚上拴上绳子给拖进坟坑里，就像掩埋患鼠疫而死的人的尸体一样。
城里散布着有关亚历山大六世之死的各种传闻。威尼斯特使安东尼奥·朱斯蒂尼雅尼向共和国汇报说，教皇临死的时候看见一只猿猴在房间里跳来跳去，逗弄他。一位枢机主教建议把猿猴捉住，教皇惊恐地大叫道：“别动它，别动它：这是魔鬼！”另一些人说，他重复道：“我走了，我走了，只是再稍等一下！”这些人解释说，当年英诺森八世逝世以后选举新教皇时，罗德里戈·博尔吉亚——未来的亚历山大六世与魔鬼签约，魔鬼让他当教皇十二年，条件是他把自己的灵魂交给魔鬼。还说，在他死的那一刻，他的床头出现了七个小鬼；他刚一死，尸体就开始腐烂，嘴里往外冒着白沫，就像生着火的锅里一样翻滚沸腾，尸体膨胀，鼓得像一座小山，完全失去了人的模样，变得发黑，“像是煤炭，或者黑布，而脸则变得像是黑人的脸”。
可是掩埋了尸体以后也没得安宁：百姓中间的恐惧日益加强。罗马城里本来笼罩着疟疾致命的气氛，这时又增加了一种新的前所未有的更让人厌恶的臭气。圣彼得大教堂里，出现一条黑狗，以异常快的速度转着规整的圆圈不停地跑。城里的居民天一黑就不敢走出家门。
关于这些事件和传闻，乔万尼在胡斯教派捷克人瘸腿扬在西尼巴尔迪胡同开的那家小酒店里了解得很详细。
这个时候，塞萨尔也处于生与死的边缘上。
在那些可怕的日子里，他保持了完全的平静；关注着发生的各种事件，听取汇报，口授信函，下达命令。教皇逝世的消息传来以后，他下令通过梵蒂冈的秘密通道把自己抬到圣安琪儿要塞去。
许多人坚信，教皇亚历山大六世死于非命——将要复生，重新坐上教皇的宝座——到那时就开始反基督统治的王国。
医生——加斯帕莱·托雷拉主教给他实施了非同寻常的治疗方法：让人剖开骡子的腹部，把打着寒战的患者放进血淋淋热气腾腾的内脏里；然后再把他浸在冰水里。与其说是因为治疗，不如说是由于难以置信的毅力，塞萨尔战胜了疾病。
