1998年4月26日，联赛第31轮，博洛尼亚队客场以3：1战胜布雷西亚队，巴乔头顶脚踢连下两城，他的表现异常出色，盖过了场上的任何球员。巴乔的个人赛季进球已达18个，与巴蒂斯图塔并列第五位，意大利国家队主帅老马尔蒂尼专程来看巴乔的比赛，给巴乔带来无限动力，他的表现深深打动了老马尔蒂尼的心，使巴乔入选国家队出征世界杯的希望大大增加。而博洛尼亚队从这场胜利中取得三分，名次再次前移，超过AG米兰跃居第九位。一周后，博洛尼亚队主场和恩波利队战成4：4，巴乔又攻入一球。5月10日，博洛尼亚客场2：3不敌尤文图斯，让尤文图斯队提前一轮夺走联赛冠军，在那场比赛上，巴乔在第55分钟时攻入一球，使自己的进球数达到20个。
以这样的成绩来衡量，巴乔在博洛尼亚可以说实现了当初的目标，他已引起了意大利国家队主教练老马尔蒂尼的足够重视，他不仅是该赛季博洛尼亚队最出色的球员，甚至可以说是整个意大利本土球员中表现最杰出的一位，这样的球员不代表国家队出征谁还更有资格呢？
转眼，联赛的赛程过半，博洛尼亚还没有摆脱降级的阴影。2月8日，博洛尼亚又迎来一场硬战，客场对排名榜首的豪华军团国际米兰，在上半程的主场比赛中，博洛尼亚队以2：4负于对手，这次客场比赛更是凶多吉少。可是，在巴乔的率领下，博洛尼亚队却在米兰圣西罗球场打得有声有色。罗纳尔多状态低靡，在那场比赛上，巴乔的光芒盖过了这位新当选的世界足球先生。上半场博洛尼亚的肯·安德森和科利瓦诺夫就频频威胁对手大门，只是运气稍差未能破门。下半场第12分钟，巴乔带球突入国际米兰队禁区，面对后卫和门将的封堵，他巧妙地用脚后跟将球回传给紧跟在后的本队后卫帕拉马蒂，帕拉马蒂起脚轻射，球从帕柳卡的胯下滚入网内，凭此球，博洛尼亚队客场战胜了强大的国际米兰，爆出了本轮的最大冷门。巴乔的能力再次得到了各方的赞扬，也许国际米兰的老板莫拉蒂由此也更加坚定了下个赛季要把巴乔挖到国际米兰的决心。博洛尼亚借此战胜利，排名上升一位，并为以后的节节胜利掀开了序幕。 1998年4月19日，博洛尼亚在主场迎来了米兰的另一支球队AC米兰。对巴乔来说，这又是一场意义不同一般的比赛，因为几个月以前， AC米兰以及他们的主教练卡佩罗把巴乔从AC米兰赶了出来，认为巴乔已是一名没有价值的球员。巴乔离开米兰后，AC米兰组织了一套新阵容，可是效果却并不理想，排名一直在中游徘徊。不过自1974年以来，AC米兰还从来没有在博洛尼亚输过球，因此他们拥有心理优势。可是，拥有他们弃将罗伯特·巴乔的博洛尼亚队却给了他们一个下马威。第59分钟，巴乔首开纪录，博队以1：0领先，83分钟，冯托兰将比分扩大为2：0，终场前一分钟，巴乔再施绝杀，使博洛尼亚队以3：0大获全胜。赛后意大利媒体给巴乔打了本轮意甲所有球员的最高分：8分，并评价说：“巴乔的天才发挥使博洛尼亚队24年来首次击败对手，他那两个进球就像是魔术师的表演，令人叹服。巴乔没有什么可担心的了，现在只等着去法国参加世界杯了。”巴乔的神勇表现令他的老雇主颜面尽失，而博洛尼亚球迷则倾城为之狂欢，因为这样的胜利过去二十几年他们想都不敢想。此战胜利之后，博洛尼亚队的排名继续上扬，以4：1分跃居第十位，仅比AC米兰少1分。
1998年5月17日，该赛季联赛最后一轮全面展开，博洛尼亚队主场迎战劲旅拉齐奥。巴乔状态极佳，率队以2：1击退强敌，巴乔包办本队两粒入球。博洛尼亚队的排名再次跃前一名，超过桑普多利亚位列第八，取得了参加下赛季欧洲联盟杯的资格。巴乔以22粒入球最终位列射手榜第三名，仅次于比埃尔霍夫和罗纳尔多，是意大利本上球员中进球最多的球员，也创造了巴乔个人的单季入球纪录，此前他曾于1992-1993赛季代表尤文图斯攻进了21个联赛入球。此外，他还在意大利杯赛上出场3次攻入1球。
